Pojavljuje se u gradskim otpadnim vodama.
Prošlog januara, tim istraživača koji je tragao za korona virusom u otpadnim vodama Njujorka primijetio je nešto čudno u svojim uzorcima. Djelići virusa koje su pronašli imali su jedinstvenu strukturu mutacije koje nikada ranije nisu prijavljene kod pacijenata - potencijalni znak nove, ranije neotkrivene varijante.
Tokom protekle godine, ove čudne sekvence, ili ono što naučnici nazivaju "zagonetne loze", nastavile su da se pojavljuju u gradskim otpadnim vodama. Nema dokaza da loze, koje kruže najmanje godinu dana, predstavljaju povećan zdravstveni rizik za ljude. Ali istraživači, čiji su nalazi objavljeni u Nature Communications u četvrtak, još uvijek nemaju pojma odakle su došli.
"U ovom trenutku, ono što možemo da kažemo je da nismo pronašli zagonetne loze u ljudskim bazama podataka, a sve živo smo pregledali", rekla je Monika Truhiljo, mikrobiolog sa Koledža Kvinsborou i autorka novog rada.
Sami istraživači su uznemireni oko porekla loze. Čak navode da virus dolazi od ljudi čije infekcije nisu uhvaćene tokom testriranja na virus. Ali drugi sumnjaju da loze možda potiču od životinja zaraženih virusom, vjerovatno ogromne populacije pacova u gradu. Čak i tada, omiljena teorija može da se mijenja iz dana u dan ili iz sata u sat. Odgovori ostaju nedostižni.
"Mislim da je zaista važno da pronađemo izvor, ali nismo u mogućnosti da to uradimo", rekao je Džon Denehi, virolog na Kvins koledžu i autor rada.
Čudne sekvence
Istraživači - među kojima su i Mark Džonson, virolog sa Univerziteta u Misuriju, Dejvid Smit, mikrobiolog sa Teksaškog A&M univerziteta i drugi - uzorkovali su otpadnu vodu iz 14 fabrika za prečišćavanje u Njujorku od juna 2020. Iako ovaj pristup pruža ograničen pogled na virusni genom, on omogućava istraživačima da izvuku mnogo podataka iz otpadnih voda, u kojima je virus obično fragmentiran.
Fragmenti virusa sa novim obrascima mutacije pojavljivali su se više puta, otkrili su istraživači. (Nisu mogli da otkriju konkretne biljke ili djelove grada). "Do danas nismo vidjeli ove varijante među kliničkim pacijentima u Njujorku", rekao je Majkl Lanza, portparol Odeljenja za zdravlje i mentalnu higijenu grada Njujorka.
Istraživači sa Univerziteta Kalifornije u Berkliju pronašli su slične sekvence u jednoj kalifornijskoj kanalizaciji, rekla je Rouz Kantor, mikrobiolog sa univerziteta. Neprekidna potraga naučnika da shvate odakle dolaze sekvence naglašava i potencijal nadzora otpadnih voda, koji može pomoći naučnicima da prate kako se virus razvija, i izazov pronalaženja smisla za sve anomalije.
"Zaista smo se mučili pokušavajući da razumijemo šta je to što imamo", rekao je dr Truhiljo. Linije bi mogle da potiču od ljudi čije infekcije nisu otkrivene ili čiji virus nije detektovan. Ali činjenica da su se stalno pojavljivali u istih nekoliko fabrika za otpadne vode čini ovu teoriju manje vjerovatnom, rekli su istraživači, s obzirom na to da se Njujorčani, i sve varijante koje možda nose, imaju tendenciju da se kreću gradom bez ograničenja.